Skip to main content

the avatar of Vojtěch Zeisek

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2021

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2021

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj umožňující efektivně zpracovat i velká data a zautomatizovat činnosti. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Apple macOS, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Kurz je vhodný pro úplné začátečníky i mírně pokročilé. Jediným vstupním požadavkem je zájem (nebo potřeba) pracovat v příkazové řádce, typicky na linuxovém výpočetním serveru.

Kurz bude probíhat v Linuxu, ale většina věcí funguje stejně na macOS a dalších UNIXových systémech.

vojta

the avatar of Vojtěch Zeisek

Course of work with molecular data in R 2020 in České Budějovice

Course of work with molecular data in R 2020 in České Budějovice

R is nowadays probably the most powerful tool for calculations of all kinds. There are plenty of modules available for work with molecular data. Those will be introduced during the course. The course will be taught from October 19th to Friday 23rd (see below). The course will be exclusively on-line, there will be no personal meeting.

vojta Pá, 03/06/2020 - 22:39

the avatar of Vojtěch Zeisek

Low genetic differentiation despite high fragmentation in the endemic serpentinophyte Minuartia smejkalii (M. verna agg., Caryophyllaceae) revealed by RADSeq SNP markers

Low genetic differentiation despite high fragmentation in the endemic serpentinophyte Minuartia smejkalii (M. verna agg., Caryophyllaceae) revealed by RADSeq SNP markers

Minuartia smejkalii is an obligate serpentinophyte plant endemic to the Czech Republic. Since the 1960s, the species’ habitat has undergone strong human-mediated fragmentation, resulting in extinction of some populations and dramatic size reduction of the remaining populations. Thus, contrary to the typically stable serpentine habitats, M. smejkalii habitats underwent a recent and severe decline, which can exacerbate the effects of fragmentation on population genetic structure. We examined the genetic structure of all known M.

vojta Po, 01/13/2020 - 10:46

the avatar of Vojtěch Zeisek

the avatar of Vojtěch Zeisek

HybSeq course 2020

HybSeq course 2020

Intensive 4-days (5th day is not compulsory, but is open for any discussion, if there would be interest) course to learn all theory about HybSeq and practically learn how to analyze HybSeq data, how to solve all problems, and how to evaluate differences among gene trees. Important part is enough time to discuss everything, including practical problems and projects of individual participants.

vojta Čt, 12/19/2019 - 21:25

the avatar of Vojtěch Zeisek

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2020

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2020

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj umožňující efektivně zpracovat i velká data a zautomatizovat činnosti. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Apple osX, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Kurz je vhodný pro úplné začátečníky i mírně pokročilé. Jediným vstupním požadavkem je zájem (nebo potřeba) pracovat v příkazové řádce, typicky na linuxovém výpočetním serveru. Kurz bude probíhat v Linuxu, ale většina věcí funguje stejně na osX a dalších UNIXových systémech.

vojta
the avatar of Vojtěch Zeisek

Kurz práce s molekulárními daty v R 2020

Kurz práce s molekulárními daty v R 2020

R je v současnosti asi nejmocnější a nejpoužívanější nástroj na výpočty všeho druhu. Je k dispozici i celá řada modulů pro práci s molekulárními daty. Ty budou náplní kurzu.

Kurz obsahuje teorii použitých metod, tutoriály s použitím testovacích dat, úlohy pro samostatnou práci účastníků, a další.

Předchozí znalost R je výhodou, nikoli však podmínkou. Nutná je alespoň minimální znalost molekulární biologie a vhodná je předchozí znalost alespoň některých metod analýz DNA dat.

vojta Po, 10/07/2019 - 16:28

the avatar of Vojtěch Zeisek

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2019

Kurz práce v příkazové řádce Linuxu nejen pro MetaCentrum 2019

Nebojte se příkazové řádky Linuxu! Je to mocný a přívětivý nástroj. Prakticky shodně funguje příkazová řádka i v Apple osX, BSD a dalších UNIXových systémech, nejen v Linuxu. Základní znalost Linuxu není nutná. Kurz bude probíhat v Linuxu, ale většina věcí funguje stejně na osX a dalších UNIXech. Znalosti práce v Linuxu/UNIXu se hodí např. při zpracování molekulárních a jiných dat. MetaCentrum je služba CESNETu poskytující přístup k obrovské výpočetní kapacitě. Bude-li se kurzu účastnit alespoň jeden člověk nemluvící česky, kurz bude anglicky.

vojta

the avatar of Vojtěch Zeisek

Překládání openSUSE na LinuxDays 2017

Překládání openSUSE na LinuxDays 2017

Z iniciativy Hodyho proběhne na LinuxDays 2017 (asi největší, již tradiční, české setkání, příznivců, uživatelů a vývojářů Linuxu a dalších moderních otevřených technologií) lokalizační odpoledne. Kromě openSUSE se na něm představí i GNOME, Mozilla a The Document Foundation (LibreOffice).

vojta

the avatar of Vojtěch Zeisek